R语言 xcms包 specDist-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

specDist-methods(xcms)
specDist-methods()所属R语言包：xcms

                                        Distance methods for xcmsSet, xcmsRaw and xsAnnotate
                                         为距离xcmsSet，xcmsRaw和xsAnnotate方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

There are several methods for calculating a distance between two sets of peaks in xcms. specDist is the generic method.
有两套在xcms峰之间的距离计算的几种方法。 specDist是通用的方法。


参数----------Arguments----------

参数：object
a xcmsSet or xcmsRaw.
1 xcmsSet或xcmsRaw。


参数：method
Method to use for distance calculation. See details.
使用距离计算方法。查看详情。


参数：...
mzabs, mzppm and parameters for the distance function.
mzabs，mzppm和距离函数的参数。


Details

详情----------Details----------

Different algorithms can be used by specifying them with the method argument. For example to use the "meanMZmatch" approach with xcmsSet one would use: specDist(object, peakIDs1, peakIDs2, method="meanMZmatch"). This is also the default.
由他们指定method参数，可以使用不同的算法。例如，使用与xcmsSet一“meanMZmatch”的方式将使用specDist(object, peakIDs1, peakIDs2, method="meanMZmatch")。这也是默认的。

Further arguments given by ... are passed through to the function implementing the method.
由...进一步参数通过执行method的功能。

A character vector of nicknames for the  algorithms available is returned by  getOption("BioC")$xcms$specDist.methods. If the nickname of a method is called "meanMZmatch", the help page for that specific method can be accessed with ?specDist.meanMZmatch.
由getOption("BioC")$xcms$specDist.methods返回一个特征向量算法的昵称。如果一个方法的外号叫“meanMZmatch”，具体方法，帮助页面，可以用?specDist.meanMZmatch访问。


值----------Value----------


参数：mzabs
maximum absolute deviation for two matching peaks  
两个匹配峰的最大绝对偏差


参数：mzppm
relative deviations in ppm for two matching peaks  
在PPM的两个匹配峰的相对偏差


参数：symmetric
use symmetric pairwise m/z-matches only, or each match  
使用对称成对M / Z-匹配，或每场比赛


方法----------Methods----------

                specDist(object, peakIDs1, peakIDs2,...)                
                specDist(object, peakIDs1, peakIDs2,...)                

        specDist(object, PSpec1, PSpec2,...)                
        specDist(object, PSpec1, PSpec2,...)                


作者（S）----------Author(s)----------


Joachim Kutzera, <a href="mailto:jkutzer@ipb-halle.de">jkutzer@ipb-halle.de</a>

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。