R语言 xcms包 retcor.peakgroups-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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retcor.peakgroups-methods(xcms)
retcor.peakgroups-methods()所属R语言包：xcms

                                        Align retention times across samples
                                         对齐跨样品的保留时间

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These two methods use “well behaved” peak groups to calculate retention time deviations for every time point of each sample. Use smoothed deviations to align retention times.  
这两种方法使用“表现良好”峰组来计算每个样本的每一个时间点的滞留时间偏差。使用平滑偏差调整保留时间。


参数----------Arguments----------

参数：object
the xcmsSet object
xcmsSet对象


参数：missing
number of missing samples to allow in retention time correction groups  
失踪样品的数量，使保留时间校正组


参数：extra
number of extra peaks to allow in retention time correction correction groups  
额外峰的数量，使保留时间校正校正组


参数：smooth
either "loess" for non-linear alignment or "linear" for linear alignment  
无论是非线性"loess"对齐或"linear"线性对齐


参数：span
degree of smoothing for local polynomial regression fitting  
局部多项式回归拟合平滑度


参数：family
if gaussian fitting is by least-squares with no outlier removal, and if symmetric a re-descending M estimator is used with Tukey's biweight function, allowing outlier removal  
如果gaussian装修是没有离群去除最小二乘，如果symmetric重新降的M估计用于Tukey的biweight功能，使去除离群


参数：plottype
if deviation plot retention time deviation points and regression fit, and if mdevden also plot peak overall peak density and retention time correction peak density  
如果deviation图的保留时间偏差点和回归拟合，如果mdevden还绘制高峰的整体峰值密度和保留时间校正峰值电流密度


参数：col
vector of colors for plotting each sample
向量绘图每个样品的颜色


参数：ty
vector of line and point types for plotting each sample
线和点类型的矢量绘制每个样品


值----------Value----------

An xcmsSet object
xcmsSet对象


方法----------Methods----------

retcor(object, missing = 1, extra = 1,        smooth = c("loess", "linear"), span = .2,        family = c("gaussian", "symmetric"),        plottype = c("none", "deviation", "mdevden"),        col = NULL, ty = NULL)
retcor(object, missing = 1, extra = 1,        smooth = c("loess", "linear"), span = .2,        family = c("gaussian", "symmetric"),        plottype = c("none", "deviation", "mdevden"),        col = NULL, ty = NULL)


参见----------See Also----------

xcmsSet-class, loess retcor.obiwarp  
xcmsSet-class，loessretcor.obiwarp

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注：
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