group-methods(xcms)
group-methods()所属R语言包:xcms
Group peaks from different samples together
从不同样品组峰
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A number of grouping (or alignment) methods exist in XCMS. group is the generic method.
一个分组(或校准)方法存在在XCMS。 group是通用的方法。
参数----------Arguments----------
参数:object
xcmsSet-class object
xcmsSet-class对象
参数:method
Method to use for grouping. See details.
使用的方法进行分组。查看详情。
参数:...
Optional arguments to be passed along
要通过沿可选参数
Details
详情----------Details----------
Different algorithms can be used by specifying them with the method argument. For example to use the density-based approach described by Smith et al (2006) one would use: group(object, method="density"). This is also the default.
由他们指定method参数,可以使用不同的算法。例如,使用Smith等(2006)所描述的基于密度的方法,将使用group(object, method="density")。这也是默认的。
Further arguments given by ... are passed through to the function implementing the method.
由...进一步参数通过执行method的功能。
A character vector of nicknames for the algorithms available is returned by getOption("BioC")$xcms$group.methods. If the nickname of a method is called "mzClust", the help page for that specific method can be accessed with ?group.mzClust.
由getOption("BioC")$xcms$group.methods返回一个特征向量算法的昵称。如果一个方法的绰号被称为“mzClust”,具体方法的帮助页可以访问?group.mzClust。
值----------Value----------
An xcmsSet object with peak group assignments and statistics.
xcmsSet峰集团分配和统计对象。
方法----------Methods----------
group(object, ...)
group(object, ...)
参见----------See Also----------
group.density group.mzClust xcmsSet-class,
group.densitygroup.mzClustxcmsSet-class
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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