R语言 xcms包 getPeaks-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getPeaks-methods(xcms)
getPeaks-methods()所属R语言包：xcms

                                        Get peak intensities for specified regions
                                         取得指定区域的峰强度

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Integrate extracted ion chromatograms in pre-defined defined regions. Return output similar to findPeaks.
整合在预定义的定义区域提取离子色谱。返回输出类似findPeaks的。


参数----------Arguments----------

参数：object
the xcmsSet object
xcmsSet对象


参数：peakrange
matrix or data frame with 4 columns: mzmin, mzmax, rtmin, rtmax (they must be in that order or named)  
矩阵或4列的数据框：mzmin，mzmax，rtmin，rtmax（他们必须在该命令或命名）


参数：step
step size to use for profile generation
步长，使用个人资料的代


值----------Value----------

A matrix with columns:
一个矩阵的列：


参数：i
rank of peak identified in merged EIC (<= max), always NA  
在合并后的EIC确定峰值排名（<=max），总是NA


参数：mz
weighted (by intensity) mean of peak m/z across scans  
加权（强度）意味着整个扫描峰的m / z


参数：mzmin
m/z of minimum step  
最小步长为m / z


参数：mzmax
m/z of maximum step  
最大步的m / z


参数：ret
retention time of peak midpoint  
高峰期的中点的保留时间


参数：retmin
leading edge of peak retention time  
峰的保留时间的领先优势


参数：retmax
trailing edge of peak retention time  
峰的保留时间后缘


参数：into
integrated area of original (raw) peak  
综合区原（原）高峰


参数：intf
integrated area of filtered peak, always NA  
过滤峰的积分面积，总是NA


参数：maxo
maximum intensity of original (raw) peak  
原（原）峰的最大强度


参数：maxf
maximum intensity of filtered peak, always NA  
最大强度过滤高峰，总是NA


方法----------Methods----------

getPeaks(object, peakrange, step = 0.1)
getPeaks(object, peakrange, step = 0.1)


参见----------See Also----------

xcmsRaw-class
xcmsRaw-class

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。