R语言 xcms包 getEIC-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getEIC-methods(xcms)
getEIC-methods()所属R语言包：xcms

                                        Get extracted ion chromatograms for specified m/z ranges
                                         提取指定的m / z范围的离子色谱

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generate multiple extracted ion chromatograms for m/z values of interest.  For xcmsSet objects, reread original raw data and apply precomputed retention time correction, if applicable.
生成多个感兴趣的m / z值提取离子色谱图。 xcmsSet对象，重读原始数据，并适用于预先计算的保留时间校正，如适用。


参数----------Arguments----------

参数：object
the xcmsRaw or xcmsSet object
xcmsRaw或xcmsSet对象


参数：mzrange
either a two column matrix with minimum or maximum m/z or a matrix of any dimensions containing columns mzmin and mzmax  for xcmsSet objects, if left blank the group data will be used instead  
无论是两个最大或最小的m / z或载列的任何尺寸的矩阵列的矩阵mzmin和mzmaxxcmsSet对象，如果留空组的数据将被用来代替


参数：rtrange
a two column matrix the same size as mzrange with minimum and maximum retention times between which to return EIC data points  for xcmsSet objects, it may also be a single number specifying the time window around the peak to return EIC data points  
一个两列的矩阵大小相同mzrange之间返回xcmsSet对象为三电数据点的最低和最高的保留时间，它也可能是单数指定的时间窗口，绕峰回三电数据点


参数：step
step size to use for profile generation
步长，使用个人资料的代


参数：groupidx
either character vector with names or integer vector with indicies of peak groups for which to get EICs  
无论名称或峰组的序号为整数向量的特征向量得到EICs


参数：sampleidx
either character vector with names or integer vector with indicies of samples for which to get EICs  
无论是与序号为为得到EICs的的样品名称或整数向量的特征向量


参数：rt
"corrected" for using corrected retention times, or "raw" for using raw retention times  
"corrected"使用原始的保留时间校正保留时间，或"raw"使用


值----------Value----------

For xcmsRaw objects, if rtrange is NULL, an intensity matrix with a row for each mzmin, mzmax pair. Columns correspond to individual scans. If rtrange is not NULL, a list of two column (retention time/intensity) matricies, one for each mzmin, mzmax pair.
xcmsRaw对象，如果rtrange是空的，每个mzmin，mzmax对连续的强度矩阵。列对应个别扫描。如果“rtrange是不是NULL，两列（保留时间/强度）基质中，一个每个mzmin，mzmax对的列表。

For xcmsSet objects, an xcmsEIC object.
xcmsSet对象，xcmsEIC对象。


方法----------Methods----------

getEIC(object, mzrange, rtrange = NULL, step = 0.1)
getEIC(object, mzrange, rtrange = NULL, step = 0.1)

getEIC(object, mzrange, rtrange = 200, groupidx,         sampleidx = sampnames(object), rt = c("corrected", "raw"))
getEIC(object, mzrange, rtrange = 200, groupidx,         sampleidx = sampnames(object), rt = c("corrected", "raw"))


参见----------See Also----------

xcmsRaw-class, xcmsSet-class, xcmsEIC-class
xcmsRaw-class，xcmsSet-class，xcmsEIC-class

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