R语言 xcms包 findPeaks-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

findPeaks-methods(xcms)
findPeaks-methods()所属R语言包：xcms

                                        Feature detection for GC/MS and LC/MS Data - methods
                                         特征检测的GC / MS和LC / MS数据 - 方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A number of peak pickers exist in XCMS. findPeaks is the generic method.
一个高峰期采摘的数量存在在XCMS。 findPeaks是通用的方法。


参数----------Arguments----------

参数：object
xcmsRaw-class object
xcmsRaw-class对象


参数：method
Method to use for peak detection. See details.
使用峰值检测的方法。查看详情。


参数：...
Optional arguments to be passed along
要通过沿可选参数


Details

详情----------Details----------

Different algorithms can be used by specifying them with the method argument. For example to use the matched filter approach described by Smith et al (2006) one would use: findPeaks(object, method="matchedFilter"). This is also the default.
由他们指定method参数，可以使用不同的算法。例如使用史密斯等人所描述的匹配滤波器方法（2006年），将使用findPeaks(object, method="matchedFilter")。这也是默认的。

Further arguments given by ... are passed through to the function implementing the method.
由...进一步参数通过执行method的功能。

A character vector of nicknames for the  algorithms available is returned by  getOption("BioC")$xcms$findPeaks.methods. If the nickname of a method is called "centWave", the help page for that specific method can be accessed with ?findPeaks.centWave.
由getOption("BioC")$xcms$findPeaks.methods返回一个特征向量算法的昵称。如果一个方法的绰号被称为“centWave”，具体方法的帮助页可以访问?findPeaks.centWave。


值----------Value----------

A matrix with columns:
一个矩阵的列：


参数：mz
weighted (by intensity) mean of peak m/z across scans  
加权（强度）意味着整个扫描峰的m / z


参数：mzmin
m/z of minimum step  
最小步长为m / z


参数：mzmax
m/z of maximum step  
最大步的m / z


参数：rt
retention time of peak midpoint  
高峰期的中点的保留时间


参数：rtmin
leading edge of peak retention time  
峰的保留时间的领先优势


参数：rtmax
trailing edge of peak retention time  
峰的保留时间后缘


参数：into
integrated area of original (raw) peak  
综合区原（原）高峰


参数：maxo
maximum intensity of original (raw) peak  
原（原）峰的最大强度

and additional columns depending on the choosen method.
和额外的列取决于所选的方法。


方法----------Methods----------

     findPeaks(object, ...)   
     findPeaks(object, ...)   


参见----------See Also----------

findPeaks.matchedFilter findPeaks.centWave xcmsRaw-class
findPeaks.matchedFilterfindPeaks.centWavexcmsRaw-class

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。