R语言 xcms包 calibrate-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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calibrate-methods(xcms)
calibrate-methods()所属R语言包：xcms

                                        Calibrate peaks for correcting unprecise m/z values
                                         校准的，纠正unprecise的m / z值的峰

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calibrate peaks of a xcmsSet via a set of known masses
校准通过一组已知的群众一个xcmsSet峰


参数----------Arguments----------

参数：object
a xcmsSet object with uncalibrated mz
xcmsSet对象与未校准MZ


参数：calibrants
a vector or a list of vectors with reference m/z-values
参照M / z值向量或向量列表


参数：method
the used calibrating-method, see below
用于校准的方法，见下文


参数：mzppm
the relative error used for matching peaks in ppm (parts per million)
相对误差匹配峰PPM（百万分之一）


参数：mzabs
the absolute error used for matching peaks in Da
用于匹配在大峰的绝对误差


参数：neighbours
the number of neighbours from wich the one with the highest intensity is used (instead of the nearest)
wich邻居的数量与强度最高的使用（而不是最近的）


参数：plotres
can be set to TRUE if wanted a result-plot showing the found m/z with the distances and the regression
可以设置为TRUE，如果想图显示发现M / z的距离和回归的结果


值----------Value----------


参数：object
a xcmsSet with one ore more samples
与一个或更多的样本xcmsSet


参数：calibrants
for each sample different calibrants can be used, if a list of m/z-vectors is given. The length of the list must be the same as the number of samples, alternatively a single vector of masses can be given which is used for all samples.
不同的校准物，每个样品可以使用，如果m / z为向量。列表的长度必须是相同的样本数量，或者单一向量的群众可以得到，这是对所有样品使用。


参数：method
"shift" for shifting each m/z, "linear" does a linear regression and adds a linear term to each m/z. "edgeshift" does a linear regression within the range of the mz-calibrants and a shift outside.
转移每个M / Z的“转移”，“线性”做线性回归，并增加了线性每个任期为m / z。 “edgeshift”MZ-校准物和转变以外的范围内的线性回归。


方法----------Methods----------

     calibrate(object, calibrants,method="linear",     mzabs=0.0001, mzppm=5,     neighbours=3, plotres=FALSE)   
     calibrate(object, calibrants,method="linear",     mzabs=0.0001, mzppm=5,     neighbours=3, plotres=FALSE)   


参见----------See Also----------

xcmsSet-class,
xcmsSet-class

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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