R语言 vsn包 justvsn()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

justvsn(vsn)
justvsn()所属R语言包：vsn

                                        Wrapper functions for vsn
                                         VSN的包装函数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

justvsn is equivalent to calling
justvsn相当于调用


用法----------Usage----------


justvsn(x, ...)
vsnrma(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
For justvsn, any kind of object for which vsn2 methods exist. For vsnrma, an AffyBatch.
justvsn，任何类型的对象而存在vsn2方法。对于vsnrma，AffyBatch。


参数：...
Further arguments that get passed on to vsn2.
获得通过的vsn2进一步的论据。


Details

详情----------Details----------

vsnrma does probe-wise background correction and between-array normalization by calling vsn2 on the perfect match (PM) values only. Probeset summaries are calculated with the medianpolish algorithm of rma.
vsnrma探针明智的背景校正通过调用vsn2绝配（下午）只重视和阵列间标准化。 probeset摘要计算与rmamedianpolish算法。


值----------Value----------

justvsn returns the vsn-normalised intensities in an object generally of the same class as its first argument (see the man page of predict for details). It preserves the metadata.
justvsn返回的的VSN标准化强度对象一般作为第一个参数相同的类（详见手册页predict）。它保留了元数据。

vsnrma returns an ExpressionSet.
vsnrma返回一个ExpressionSet。


作者（S）----------Author(s)----------


Wolfgang Huber



参见----------See Also----------

vsn2
vsn2


举例----------Examples----------


##--------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- - ]
## use "vsn2" to produce a "vsn" object[＃使用“vsn2”，产生一种“VSN”对象]
##--------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- - ]
data("kidney")
fit = vsn2(kidney)
nkid = predict(fit, newdata=kidney)

##--------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- - ]
## justvsn on ExpressionSet[＃justvsn上ExpressionSet]
##--------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- - ]
nkid2 = justvsn(kidney)
stopifnot(identical(exprs(nkid), exprs(nkid2)))

##--------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- - ]
## justvsn on RGList[＃justvsn上RGList]
##--------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- - ]
rg = new("RGList", list(R=exprs(kidney)[,1,drop=FALSE], G=exprs(kidney)[,2,drop=FALSE]))
erge = justvsn(rg)

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