robustSds(VanillaICE)
robustSds()所属R语言包:VanillaICE
Calculate robust estimates of the standard deviation
计算标准偏差的稳健估计
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Uses the median absolute deviation (MAD) to calculate robust estimates of the standard deviation
采用中位数绝对偏差(MAD)的计算标准偏差的稳健估计
用法----------Usage----------
robustSds(x, takeLog = FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
A matrix of copy number estimates. Rows are features, columns are samples.
拷贝数估计矩阵。行功能,列样品。
参数:takeLog
Whether to log-transform the copy number estimates before computing robust sds
改造前计算强大的SDS是否记录拷贝数估计
参数:...
additional arguments to rowMedians
额外的参数rowMedians
Details
详情----------Details----------
For matrices x with 4 or more samples, the row-wise MAD (SNP-specific sds) are scaled by sample MAD / median(sample MAD).
对于矩阵x行明智的疯狂(SNP具体SDS),4个或更多的样品,样本缩放疯狂/中位数(样本MAD)的。
If the matrix has 3 or fewer samples, the MAD of the sample(s) is returned.
如果矩阵有3个或更少的样品,样品MAD()返回。
值----------Value----------
Matrix of standard deviations.
矩阵的标准偏差。
举例----------Examples----------
data(locusLevelData, package="oligoClasses")
sds <- robustSds(locusLevelData[["copynumber"]]/100,
takeLog=TRUE)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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