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R语言 TSSi包 subtract-functions()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:48:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
subtract-functions(TSSi)
subtract-functions()所属R语言包:TSSi

                                         Subtract functions
                                         减函数

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Functions subtracting the expectation value used in the identification of TSS.
减去期望值,用于确定在TSS的功能。


用法----------Usage----------


subtractExpectation(fg, bg, indTss, pos, basal, tau, extend=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:fg
Numeric vector with foreground.
数字矢量与前景。


参数:bg
Numeric vector with background of the same length as fg.
数字矢量与背景相同的长度为fg。


参数:indTss
Index vector indicating the expected TSS sites in fg.
索引向量表示预期fgTSS的网站。


参数:pos
Positions of the reads in the segment, as given in the segmentizeCounts method.
在段读取的立场,在segmentizeCounts方法给出。


参数:basal
See the normalizeCounts method.
看到normalizeCounts方法。


参数:tau
See the identifyStartSites method.
看到identifyStartSites方法。


参数:extend
Logical indicating whether the background estimates should be computed for all positions, rather than only for those with reads.
逻辑表示的背景估计是否应计算所有职位,而不是只读取这些。


Details

详情----------Details----------

The subtractExpectation function is one approach on how to subtract the expectation value.
subtractExpectation函数是如何减去期望值的方法。

Other functions with the same call structure can be used in the detection of the TSS by passing it as fun argument in the identifyStartSites method.
通过fun方法identifyStartSites参数具有相同的调用结构等功能,可用于检测的TSS。


参见----------See Also----------

Classes: TssData, TssNorm, TssResult
类别:TssData,TssNorm,TssResult

Methods: segmentizeCounts, normalizeCounts, identifyStartSites, get-methods, plot-methods, asRangedData-methods
方法:segmentizeCounts,normalizeCounts,identifyStartSites,get-methods,plot-methods,asRangedData-methods

Functions: subtract-functions
功能:subtract-functions

Data set: physcoCounts
数据集:physcoCounts

Package: TSSi-package
包装:TSSi-package


举例----------Examples----------


args(subtractExpectation)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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