R语言 TSSi包 get-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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get-methods(TSSi)
get-methods()所属R语言包：TSSi

                                         Get methods
                                         Get方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Get methods for objects of the classes TssData, TssNorm, and TssResult.
获取对象的类的方法TssData，TssNorm，TssResult。


值----------Value----------

A data frame or list
一个数据框或列表


方法----------Methods----------

For class TssData, TssNorm (inherited), TssResult (inherited):
类TssData，TssNorm（继承），TssResult（继承）：

signature(x="TssData")
signature(x="TssData")

Get the read start sites. The second argument selects the individual segment; if missing returns a list containing the information of all segments.
获取读的起始位点。第二个参数选择个别段;如果缺少返回一个列表，其中包含所有段的信息。

signature(x="TssData")
signature(x="TssData")

Get the read end sites; see start.
获取读年底网站看到start。

signature(x="TssData")
signature(x="TssData")

Get the raw read counts; see start.
获取原料读计数;看到start。

signature(x="TssData")
signature(x="TssData")

Get all the read data of the segments, including e.g. "start", "counts", "replicate"; see start.
获取所有分部的只读数据包括，例如， “开始”，“计数”，“复制”;看到start。

signature(x="TssData")
signature(x="TssData")

Get the information associated with the segments, e.g. chromosome, strand, region. The optional second and third arguments select the segment and the variable of interest.
获取与段相关的信息，例如：染色体，钢绞线，区域。可选的第二个和第三个参数选择段和感兴趣的变量。

signature(x="TssData")
signature(x="TssData")

Get the annotation data, as passed through the annotation argument.
获取的注释数据，通过annotation参数传递。

signature(x="TssData")
signature(x="TssData")

Subset the object, by name or index.  
子集对象的名称或索引。

For class TssNorm, TssResult (inherited):
类TssNorm，TssResult（继承）：

signature(x="TssNorm")
signature(x="TssNorm")

Get the normalized reads based on the Poisson ratios; see start.
归读取基于泊松比;看到start。

signature(x="TssNorm")
signature(x="TssNorm")

Get the normalized reads based on the fit; see start.  
归读合适的;看到start。

For class TssResult:
类TssResult：

signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")

Get the expectation for non-specific reads; see start.
非特异性读取的期望;看到start。

signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")

Get the identified transcription start sites; see start.  
得到确定的转录起始位点;看到start。


作者（S）----------Author(s)----------



Maintainer: Julian Gehring <julian.gehring@fdm.uni-freiburg.de>




参见----------See Also----------

Classes: TssData, TssNorm, TssResult
类别：TssData，TssNorm，TssResult

Methods: segmentizeCounts, normalizeCounts, identifyStartSites, get-methods, plot-methods, asRangedData-methods
方法：segmentizeCounts，normalizeCounts，identifyStartSites，get-methods，plot-methods，asRangedData-methods

Functions: subtract-functions
功能：subtract-functions

Data set: physcoCounts
数据集：physcoCounts

Package: TSSi-package
包装：TSSi-package


举例----------Examples----------


example(segmentizeCounts)

## some examples for get methods[＃一些例子get方法]
start(x)
head(start(x, 1))

head(reads(x, 1))

segments(x)
names(x)

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