R语言 topGO包 topGOresult-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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topGOresult-class(topGO)
topGOresult-class()所属R语言包：topGO

                                        Class "topGOresult"
                                         类“topGOresult”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Class instance created by
创建类的实例


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("topGOresult",     description, score, testName, algorithm, geneData).
创建对象可以通过检测的形式new("topGOresult",     description, score, testName, algorithm, geneData)。


插槽----------Slots----------




description: character string containing a
description：字符串包含




score: named numerical vector containing the
score：命名数值向量




testName: character string containing the name
testName：字符串包含名称




algorithm: character string containing the name
algorithm：字符串包含名称




geneData: list containing summary statistics
geneData：列表，其中包含汇总统计


方法----------Methods----------




score: method to access the score slot.
score：score槽的方法来访问。




testName: method to access the testName slot.
testName：testName槽的方法来访问。




algorithm: method to access the algorithm slot.
algorithm：algorithm槽的方法来访问。




geneData: method to access the geneData slot.
geneData：geneData槽的方法来访问。




show: method to print the object.
show：方法来打印的对象。




combineResults: method to aggregate two or more topGOresult objects. method = c("gmean", "mean", "median",       "min", "max") provides the way the object scores (which most of
combineResults：总的两个或两个以上的topGOresult对象的方法。 method = c("gmean", "mean", "median",       "min", "max")提供对象的分数（最

.
。


作者（S）----------Author(s)----------


Adrian Alexa



参见----------See Also----------

groupStats-class, getSigGroups-methods
groupStats-class，getSigGroups-methods


举例----------Examples----------



data(results.tGO)

s <- score(resultFisher)

go <- sort(names(s))
go.sub<- sample(go, 100)
go.mixed <- c(sample(go, 50), sample(ls(GOCCTerm), 20))
go.others <- sample(ls(GOCCTerm), 100)


str(go)
str(go.sub)
str(go.mixed)
str(go.others)

str(score(resultFisher, whichGO = go))
str(score(resultFisher, whichGO = go.sub))
str(score(resultFisher, whichGO = go.mixed))
str(score(resultFisher, whichGO = go.others))

avgResult <- combineResults(resultFisher, resultKS)
avgResult
combineResults(resultFisher, resultKS, method = "min")


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