importPhenoData(tkWidgets)
importPhenoData()所属R语言包:tkWidgets
Functions to input data for an AnnotatedDataFrame object
输入数据为AnnotatedDataFrame对象的功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This functions allow users to read data from an existing file or an R data.frame object and use the data frame to construct an AnnotatedDataFrame object.
此功能允许用户从现有的文件或一个R数据框对象中读取数据,并使用数据框的构建AnnotatedDataFrame对象。
用法----------Usage----------
importPhenoData(fileName, sampleNames = NULL, from = NULL)
createPData(pdata, varList)
writePDRowNames(pdata, sampleNames)
writePhenoTable(base, textWidget, pdata)
makePhenoData(pdata)
convert2PData(phenoList)
getOBJWidget(type = NULL)
objExists(name, type = NULL)
getSNCNums(sampleNames)
getCovarDesc(varList)
参数----------Arguments----------
参数:fileName
a character string for the name of a file that is going to be used to build an AnnotatedDataFrame object.
一个文件将被用来建立一个AnnotatedDataFrame对象的名称的字符串。
参数:sampleNames
a vector of character strings for the names of samples. The length of sampleNames should be the same as the number of rows of an existing file or data.frame if an AnnotatedDataFrame object is to be created based on a file or data.frame.
样品的名称的字符串向量。 sampleNames长度应该作为一个现有的文件或数据框的行数相同,,如果AnnotatedDataFrame对象是要创建的文件或数据框的基础上。
参数:pdata
a data.frame for the experimental data.
为实验数据的数据框。
参数:base
an RTcl object for the base window a widget resides.
RTCL对象为碱基窗口小部件所在。
参数:textWidget
an RTcl object for a text box widget.
一个文本框构件的的RTCL对象。
参数:phenoList
a list of lists for tclVar() objects.
为tclVar()对象的名单列表。
参数:type
a character string for the class of a object e.g. data.frame, AnnotatedDataFrame.
一个类的,例如对象的字符串数据框,AnnotatedDataFrame。
参数:name
a character string for the name of an object.
为对象的名称的字符串。
参数:varList
a list of characters with names being covariate names and values being short descriptions of covariate names.
一个是协协名称的简短描述的名称和值的名称列表中的字符。
参数:from
a character string indicating how an AnnotatedDataFrame object will be created. "file" - create from an existing file, "object" - create from an existing data frame object, "edit" - create by editing an existing AnnotatedDataFrame object, and "new" create a new AnnotatedDataFrame object from scratch. NULL or any other values for from will invoke a widget that allows users to select one of the four means from an interface.
表明,如何AnnotatedDataFrame对象将创建一个字符串。 “文件” - 从现有的文件,创建“对象” - 从现有的数据框对象的创建,“编辑” - 创建通过编辑现有AnnotatedDataFrame的对象,“新”从头开始创建一个新AnnotatedDataFrame对象。 NULL,或from的其他任何值将调用一个部件,使用户可以选择从一个接口的四个手段之一。
Details
详情----------Details----------
When import a data.frame or AnnotatedDataFrame object, the object to be imported should have been stored in .GlobelEnv. All the objects of data.frame or AnnotatedDataFrame will be made available through a browser.
导入数据框或AnnotatedDataFrame对象时,要导入的对象应被存储在。GlobelEnv。数据框或AnnotatedDataFrame所有的对象,将可通过浏览器。
The main widget if importPhenoData that calls other functions/widgets to have the job done.
主要部件,如果importPhenoData调用其他功能/部件来完成这项工作。
Package Biobase is required for importPhenoData but the requirement id not forced as it is the only time the package is used. Users have to make sure that Biobase is available.
包BIOBASE需要为importPhenoData但要求标识不强迫,因为它是唯一的一次是用来包。用户确保BIOBASE可用。
值----------Value----------
An AnnotatedDataFrame object.
AnnotatedDataFrame对象。
注意----------Note----------
This function is intended for use by function read.phenoData of Biobase
此功能是用于功能BIOBASE read.phenoData的使用
作者(S)----------Author(s)----------
Jianhua Zhang
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
if(interactive()){
importPhenoData()
}
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