R语言 tilingArray包 plotAlongChromLegend()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotAlongChromLegend(tilingArray)
plotAlongChromLegend()所属R语言包：tilingArray

                                        Plot a legend for genomic features
                                         绘制基因组功能的一个传奇

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot a legend for genomic features
绘制基因组功能的一个传奇


用法----------Usage----------


plotAlongChromLegend(vpr, nr=2,
    featureColorScheme=1,
    featureExclude=c("chromosome", "nucleotide_match", "insertion"),
    mainLegend, cexLegend=0.35, cexMain=1)



参数----------Arguments----------

参数：vpr
vector specifying where to place the legend in figure (set up by using the  viewport function from the grid package.  When this function is called directly  by the user this argument should be left missing.
向量指定放置在人物的传说（设立通过从网格包viewport功能。当这种说法应留待失踪的用户直接调用此函数。


参数：nr
numeric scalar, specifying the number of rows to plot legend over  (default value is 2).
数字标，图例指定的行数超过（默认值是2）。


参数：featureColorScheme
numeric scalar, used to select a color scheme for the  boxes representing genomic features such as coding sequences, ncRNAs etc.  Currently the only value supported is 1.
数字标量，用于选择配色方案为代表盒基因的功能，如编码序列，非编码RNA等，目前支持的唯一的价值是1。


参数：featureExclude
character vector of names of feature types (in gff) that should not be plotted. Default is "chromosome", "nucleotide_match" and  "insertion".  Additional possible candidates include: "ARS",  "repeat\_region", "repeat\_family" and  "nc\_primary\_transcript".
特征向量的特征类型的名称不应该被绘制（gff）。默认是"chromosome""nucleotide_match"和"insertion"。其他可能的候选人包括："ARS"，"repeat\_region"，"repeat\_family"和"nc\_primary\_transcript"。


参数：mainLegend
character vector specifying legend title.
特征向量指定图例标题。


参数：cexLegend
numeric scalar specifying the magnification to be used for the legend  text relative to the current text size.
数字标指定图例文本相对当前文本大小的放大倍率。


参数：cexMain
numeric scalar specifying the magnification to be used for the legend  title relative to the current text size.
数字标指定的放大倍率，可用于相对当前文本大小图例标题。


Details

详情----------Details----------

This function is usually called by plotAlongChrom when doLegend is TRUE.  It can also be called directly by the user to produce a separate legend.  
此功能通常被称为plotAlongChrom当doLegend为TRUE。它也被称为由用户直接产生一个独立的传奇。

The following features are included in the legend (unless excluded using the featuredExclude option): "chromosome", "nucleotide_match", "pseudogene", "uORF", "nc_primary_transcript", "region", "repeat_family", "repeat_region", "transposable_element", "transposable_element_gene", "ARS", "centromere", "telomere", "insertion", "CDS", "CDS_dubious", "ncRNA", "tRNA", "snRNA", "rRNA", "snoRNA", "binding_site" and "TF_binding_site".
以下功能都包含在传说中（除非排除使用featuredExclude选项）："chromosome"，"nucleotide_match"，"pseudogene"，"uORF"，"nc_primary_transcript"。 "region"，"repeat_family"，"repeat_region"，"transposable_element"，"transposable_element_gene"，"ARS"，"centromere"，"telomere"， "insertion"，"CDS"，"CDS_dubious"，"ncRNA"，"tRNA"，"snRNA"，"rRNA"，"snoRNA"，<X >和"binding_site"。


作者（S）----------Author(s)----------


Wolfgang Huber &lt;huber@ebi.ac.uk&gt;



举例----------Examples----------



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注：
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