generateModels(tigre)
generateModels()所属R语言包:tigre
Generating models with the given data
与给定的数据生成模型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
'generateModels' recreates models based on the parameters stored in a scoreList.
“generateModels再现的基础上在scoreList存储的参数模型。
用法----------Usage----------
generateModels(preprocData, scores)
参数----------Arguments----------
参数:preprocData
The preprocessed data to be used.
预处理后的数据可以使用。
参数:scores
A scoreList object containing data of the models to be generated.
一个scoreList对象包含将要产生的模型数据。
值----------Value----------
'generateModels' returns a list of the generated models.
“generateModels返回一个列表生成的模型。
作者(S)----------Author(s)----------
Antti Honkela, Jonatan Ropponen
参见----------See Also----------
GPLearn, GPRankTargets, GPRankTFs, scoreList.
GPLearn, GPRankTargets, GPRankTFs, scoreList。
举例----------Examples----------
# Load a mmgmos preprocessed fragment of the Drosophila developmental[加载的果蝇发育mmgmos预处理片段]
# time series[时间序列]
data(drosophila_gpsim_fragment)
# Get the target probe names[获取目标探测名称]
targets <- c('FBgn0003486', 'FBgn0033188', 'FBgn0035257')
library(annotate)
aliasMapping <- getAnnMap("ALIAS2PROBE",
annotation(drosophila_gpsim_fragment))
twi <- get('twi', env=aliasMapping)
fbgnMapping <- getAnnMap("FLYBASE2PROBE",
annotation(drosophila_gpsim_fragment))
targetProbes <- mget(targets, env=fbgnMapping)
scores <- GPRankTargets(drosophila_gpsim_fragment, TF=twi,
testTargets=targetProbes,
options=list(quiet=TRUE),
filterLimit=1.8)
models <- generateModels(drosophila_gpsim_fragment, scores)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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