plotGCbias(Starr)
plotGCbias()所属R语言包:Starr
Visualize GC-Bias of Hybridization
可视化杂交GC偏置
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Generates a plot showing the GC-bias of the hybridization.
杂交GC偏置生成一个图。
用法----------Usage----------
plotGCbias(intensity, sequence, main="")
参数----------Arguments----------
参数: intensity
a vector of type numeric, containing the measured intensities.
numeric类型的向量,包含测得的强度。
参数: sequence
a vector of type character, containing the sequences.
型性格的向量,包含序列。
参数: main
head of the plot
图头
作者(S)----------Author(s)----------
Benedikt Zacher <a href="mailto:zacher@lmb.uni-muenchen.de">zacher@lmb.uni-muenchen.de</a>
参见----------See Also----------
boxplot
boxplot
举例----------Examples----------
##[#]
sequence <- unlist(lapply(1:50000, function(x) {paste(sample(c("A","T","C","G"),prob=c(0.3,0.3,0.2,0.2),25,replace=TRUE), collapse="")}))
values <- runif(50000,min=-2,max=2)
plotGCbias(values, sequence)
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