R语言 SSPA包 plotEffectSize()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotEffectSize(SSPA)
plotEffectSize()所属R语言包：SSPA

                                        Plots the density of effect sizes of the pilot data
                                         试验数据的影响大小的图密度

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function plotEffectSize plots density of effect sizes of the pilot data.
plotEffectSize图密度试验数据的影响大小的功能。


用法----------Usage----------


plotEffectSize(x, threshold = 0, xlab = "effect size", ylab = "density of effect sizes", main, sub, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
object of class SampleSize-class
对象类SampleSize-class


参数：threshold
threshold for truncation of the density of effect-sizes. The threshold will be taken symmetrical around the y-axis.
阈值的影响大小的密度截断。阈值将采取绕y轴对称。


参数：xlab
a title for the x axis
X轴的标题


参数：ylab
a title for the y axis
为Y轴的标题


参数：main
an overall title for the plot
图的总冠军


参数：sub
a sub title for the plot
一个图子称号


参数：...
additional arguments given to plot or par
额外的参数给plot或par


Details

详情----------Details----------

The density of effect sizes describes the effects observed in the pilot data. Usually a bimodal density is observed representing up- and down-regulated genes. The way in which the test statistics is calculated determines what is meant by up- and down-regulation. A small symmetrical region around zero can be defined that will be excluded from the density of effect sizes and thereby increases the estimated average power.
密度的影响大小介绍了试验数据中观察到的效果。双峰密度一般观察代表和下调的基因。在其中检验统计量的计算方法，确定和下调意味着什么。对称零附近一个小区域可以定义密度的影响大小，将被排除在外，从而提高估计的平均功耗。


参考文献----------References----------

Approximate Power and Sample Size Calculations with Microarray Data: An Illustration.

举例----------Examples----------


library(multtest)
data(golub)
teststat <- mt.teststat(golub, golub.cl)
table(golub.cl)
pd <- pilotData(name="golub", testStatistics=teststat, sampleSizeA=11, sampleSizeB=27)
hist(pd)
plot(pd)
ss <- sampleSize(pd)
plotEffectSize(ss)

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