plotBlockImage(spotSegmentation)
plotBlockImage()所属R语言包:spotSegmentation
Plot Microarray Image Block
图芯片图像块
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Displays a block of a microarray image.
显示了一个芯片的图像块。
用法----------Usage----------
plotBlockImage(z,title,one)
参数----------Arguments----------
参数:z
Intensities of the image pixels, in the form a of a matrix.
图像像素的强度,在一个矩阵形式。
参数:title
A title for the image plot (optional).
一个影像图的标题(可选)。
参数:one
Sets appropriate graphics parameters for displaying individuals spots (default:FALSE).
显示个人点(默认值:FALSE),设置适当的图形参数。
值----------Value----------
None, other than the displayed plot.
没有,比其他显示图。
参考文献----------References----------
Robust model-based segmentation of microarray images,\ Technical Report No.~473, Department of Statistics, University of Washington, January 2005.
参见----------See Also----------
spotseg
spotseg
举例----------Examples----------
data(spotSegTest)
# columns of spotSegTest:[对spotSegTest的列:]
# 1 intensities from the Cy3 (green) channel[1,从强度Cy3标记(绿色)通道]
# 2 intensities from the Cy5 (red) channel[2,从强度的Cy5的(红色)通道]
dataTransformation <- function(x) (256*256-1-x)^2*4.71542407E-05
chan1 <- matrix(dataTransformation(spotSegTest[,1]), 144, 199)
chan2 <- matrix(dataTransformation(spotSegTest[,2]), 144, 199)
plotBlockImage(chan1)
plotBlockImage(chan2)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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