R语言 splicegear包 grid.plot.Probes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

grid.plot.Probes(splicegear)
grid.plot.Probes()所属R语言包：splicegear

                                         Plot splicegear objects
                                         的图splicegear对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot objects defined in the package splicegear
在包splicegear定义的图对象


用法----------Usage----------


grid.plot.Probes(x, col = "black", add = FALSE, probepos.yscale = NULL,
              xlim = NULL, vp = NULL, ...)

grid.plot.SpliceSites(x, col.typeI = "orange", col.typeI.window = "yellow",
    col.typeII = "red", add = FALSE, ylim = NULL, vp = NULL,
    ...)

grid.plot.SpliceExprSet(x, probes.opt = list(), expr.opt = list(col = NA, lty = 1:6),
    fig.xratio = c(2, 1), fig.yratio = c(2, 1), probepos.yscale = NULL,
    ylim = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
object of Probes-class, SpliceSites-class or SpliceExprSet-class
对象Probes-class，SpliceSites-class或SpliceExprSet-class


参数：add
add to an existing plot  
添加到现有的图


参数：col
color(s) for the probes (recycled if necessary).  
探针颜色（S）（如果有必要回收）。


参数：col.typeI
color(s) for the type I spliced out exons  
我出个外显子剪接的类型颜色（S）


参数：col.typeI.window
background color for the type I spliced out "windows"  
我剪接出“窗口”型的背景颜色


参数：col.typeII
color for the type II splicing events  
颜色为II型剪接事件


参数：expr.opt
list of options to plot expression values
绘制表达值的选项列表


参数：probepos.yscale
specify coordinates on the y-axis for the probes.
指定为探针的Y轴坐标。


参数：probes.opt
options to plot the probes
选择绘制探针


参数：fig.xratio
ratio for the left and right parts of the plot
图的左边和右边的部分比


参数：fig.yratio
ratio for the upper and lower parts of the plot
比图的上部和下部


参数：vp
a viewport (grid package stuff)
一个视口（格包的东西）


参数：xlim
range for the x-axis (see plot).
为x轴的范围（见plot）。


参数：ylim
range for the y-axis
y轴的范围


参数：...
optional parameters  
可选参数


Details

详情----------Details----------

The "type I"/'type II' thing is described in the references found in the help files for plot.SpliceSites.
我/II型“的事情是在在plot.SpliceSites的帮助文件中发现的引用。


值----------Value----------

These functions are mainly used for their side effects. grid.plot.SpliceSites returns the range for the y-axis when needed.
这些功能主要用于其副作用。 grid.plot.SpliceSites返回y轴的范围，在需要的时候。


参见----------See Also----------

plot.SpliceSites, plot.Probes
plot.SpliceSites，plot.Probes


举例----------Examples----------


## plot splice sites[＃绘制剪接。]
data(spsites)
grid.plot(spsites)

## plot probes[＃图探针的]
data(probes)
grid.plot(probes)

## combined plot[＃结合图]
grid.plot(probes, spsites)


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。