as.data.frame.SpliceExprSet(splicegear)
as.data.frame.SpliceExprSet()所属R语言包:splicegear
SpliceExprSet object to data.frame converter
SpliceExprSet对象数据框转换
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Converts a SpliceExprSet object to a data.frame.
转换数据框SpliceExprSet的对象。
用法----------Usage----------
## S3 method for class 'SpliceSites'
as.data.frame(x, row.names = NA, optional = NA, ...)
## S3 method for class 'SpliceExprSet'
as.data.frame(x, row.names = NA, optional = NA, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
object SpliceSites-class or SpliceExprSet-class.
对象SpliceSites-class或SpliceExprSet-class。
参数:row.names
NULL or a character vector giving the row names for the data frame. Missing values are not allowed.
NULL或特征向量,使数据框的行名。遗漏值是不允许的。
参数:optional
logical. If TRUE, setting row names is optional.
逻辑。如果TRUE,设置行名称是可选的。
参数:...
currently ignored.
目前被忽略。
Details
详情----------Details----------
Data are traditionally stored in objects of class data.frame. This function links the object-oriented design of the package with the large amount of functions working on data.frames.
传统的数据存储类data.frame的对象。此功能连接大量的工作职能上data.frames包的面向对象的设计。
值----------Value----------
A data.frame. For both functions the first column names are begin, end, isintypeI, isintypeII, exprs and genenames. In the case of as.data.frame.SpliceExprSet, the next variable names will the ones in the AnnotatedDataFrame-class attribute of the ExpressionSet-class object belonging the SpliceExprSet-class. The last variable names will be the ones in the slot info of the Probes-class object.
Adata.frame。对于这两个函数的第一个列名begin,end,isintypeI,isintypeII,exprs和genenames。在as.data.frame.SpliceExprSet未来的变量名的AnnotatedDataFrame-classExpressionSet-class对象的属性的,属于SpliceExprSet-class。最后一个变量的名称将是那些在槽infoProbes-class对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Laurent Gautier
举例----------Examples----------
data(spliceset)
dataf <- as.data.frame(spliceset)
lm.panel <- function(x, y, ...) {
points(x,y,...)
p.lm <- lm(y~x); abline(p.lm)
}
## probe intensity values conditioned by the position of the probes on[#探针强度值条件由探针的位置上]
## the mRNA[#的mRNA]
coplot(log(exprs) ~ Material | begin, data=dataf, panel=lm.panel)
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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