spkTools(spkTools)
spkTools()所属R语言包:spkTools
Tools for Spike-in Data Analysis and Visualization
钉在数据分析和可视化的工具
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A collection of functions to examine microarray datasets that include spike-ins. In particular, it allows one to explore the distribution of spike-ins within the range of possible expression values, the relationship between nominal concentration and expression, and the relationship between expected and observed fold change for different levels of comparison.
检查芯片数据集,包括穗插件的功能集合。特别是,它允许一个探索可能的表达式的值的范围内分布的尖峰插件,预计名义浓度和表达之间的关系,之间的关系,并观察比较不同层次的fold change。
Details
详情----------Details----------
作者(S)----------Author(s)----------
Matthew N. McCall
Maintainer: Matthew N. McCall <mmccall@jhsph.edu>
举例----------Examples----------
## The Three Plots[#三个图]
data(affy)
par(mfrow=c(2,2))
affySlope <- spkSlope(affy)
spkDensity(affy, affySlope)
spkBox(affy, affySlope)
## The Full Wrapper[#完整包装]
data(affy)
spkAll(affy, label="Affymetrix", fc=2)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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