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R语言 spkTools包 spkMA()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:55:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
spkMA(spkTools)
spkMA()所属R语言包:spkTools

                                        MA Plots
                                         主图解

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots log-ratios (M) vs. average log expression (A) for a SpikeInExpressionSet object.
图log比率(男)和平均log表达(一)为SpikeInExpressionSet对象。


用法----------Usage----------


spkMA(object, spkSlopeOut, fc=2, tol=3, label=NULL, ylim=NULL,
outlier=1, reduce=TRUE, plot.legend=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:object
a SpikeInExpressionSet object
1 SpikeInExpressionSet对象


参数:spkSlopeOut
the output from the spkSlope function
从spkSlope函数的输出


参数:fc
the fold change of interest
倍的利率变化


参数:tol
the precision (number of digits after decimal point) in fc
在FC的精度(小数点后的位数)


参数:label
a character string to insert into the plot title
一个字符串插入到图的标题


参数:ylim
limits of y-axis
Y-轴的限制


参数:outlier
log fold change cut-off for outliers
为离群登录切断倍变化


参数:reduce
if TRUE some points are removed from the background to speed plotting
如果为TRUE删除一些点从背景,以加快绘图


参数:plot.legend
if TRUE a legend is plotted
如果为TRUE传说绘制


值----------Value----------

The MA plot is produced.
主图产生。


作者(S)----------Author(s)----------


Matthew N. McCall



举例----------Examples----------


data(affy)
affySlope <- spkSlope(affy)
spkMA(affy, affySlope)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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