spkBox(spkTools)
spkBox()所属R语言包:spkTools
Fold Change Calculations
倍计算
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A function to calculate the log-ratios stratified by which ALE groups yield the comparison. They are stratified by which bins are being compared to produce the given fold change.
一个函数来计算log比率分层由ALE的群体产生了比较。他们是通过分层箱正在相比,产生倍。
用法----------Usage----------
spkBox(object, spkSlopeOut, fc = 2, tol = 3, reduce=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:object
a SpikeInExpressionSet object
1 SpikeInExpressionSet对象
参数:spkSlopeOut
the output of the spkSlope function
的spkSlope函数的输出
参数:fc
the fold change of interest
倍的利率变化
参数:tol
the precision (number of digits after decimal point) in fc
在FC的精度(小数点后的位数)
参数:reduce
if TRUE the number of points plotted in the null bins is reduced
如果真点的数量在空箱绘制减少
Details
详情----------Details----------
This function requires the output of spkSlope.
此功能需要输出spkSlope。
值----------Value----------
A list with the log-ratios separated by ALE strata comparison.
与由ALE地层对比分隔log比率列表。
作者(S)----------Author(s)----------
Matthew N. McCall
举例----------Examples----------
data(affy)
affySlope <- spkSlope(affy)
spkBox(affy,affySlope)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|