writeUniqueProfileSpecificResult(SpeCond)
writeUniqueProfileSpecificResult()所属R语言包:SpeCond
Write the specific profiles from the SpeCond analysis
写从SpeCond分析特定的配置文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Produces a text file with the unique specific profiles among the conditions detected by the SpeCond analysis.
产生了独特的在由SpeCond分析检测条件的特定的配置文件的文本文件。
用法----------Usage----------
writeUniqueProfileSpecificResult(L.specific.result, file.name.unique.profile =
"specific.unique_profile.txt", full.list.gene = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:L.specific.result
the L.specific.result list of the included in the result of the main SpeCond function: generalResult$specificResult$L.specific.result
L.specific.result名单在主要SpeCond函数的结果包括:generalResult $ specificResult美元L.specific.result
参数:file.name.unique.profile
the name of the produced file containing the gene's profiles
生产含有基因的配置文件的文件名
参数:full.list.gene
If TRUE, the last column correspond to the gene's names which have the profile described in the row
如果是TRUE,最后一列对应基因的名称,有行中描述的个人资料
作者(S)----------Author(s)----------
Florence Cavalli, florence@ebi.ac.uk
参见----------See Also----------
SpeCond, getProfile, writeSpeCondResult, writeGeneResult
SpeCond,getProfile,writeSpeCondResult,writeGeneResult
举例----------Examples----------
library(SpeCond)
data(expressionSpeCondExample)
##Perform the condition specific detection analysis with SpeCond()[#执行的具体检测分析与SpeCond条件()]
generalResult=SpeCond(expressionSpeCondExample,
param.detection=NULL, multitest.correction.method="BY", prefix.file="E",
print.hist.pv=TRUE, fit1=NULL, fit2=NULL, specificOutlierStep1=NULL)
specificResult=generalResult$specificResult
##write the result file[#写的结果文件。]
writeUniqueProfileSpecificResult(L.specific.result=specificResult$L.specific.result,
file.name.unique.profile="Example_specific_unique_profile.txt", full.list.gene=FALSE)
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