R语言 SpeCond包 writeSpeCondResult()函数中文帮助文档(中英文对照)

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writeSpeCondResult(SpeCond)
writeSpeCondResult()所属R语言包：SpeCond

                                        Write in text files the main result of the SpeCond function
                                         写在文本文件中的主要结果的SpeCond功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

writeSpeCondResult produces three text files:  - The table of the gene detected as specific and in which condition they are specific (0: no specific, 1: specific up-regulated, -1:specific down-regulated). The default name is file.name.profile="specific_profile.txt". - The list of the specific genes. The default name is: "list_specific_probeset.txt". - The table of the unique specific profiles detected. The default name is: "specific_unique_profile.txt".
writeSpeCondResult产生三个文本文件： - 作为具体的，在这种条件下它们是特定（0：没有具体的，1：具体的上调，-1：具体上下调节）检测基因的表。默认名称是file.name.profile =“specific_profile.txt”。 - 列表中的特定基因。默认的名字是：的“list_specific_probeset.txt”。 - 独特的具体概况表检测。默认的名字是：“specific_unique_profile.txt”。


用法----------Usage----------


writeSpeCondResult(L.specific.result, file.name.profile =
"specific_profile.txt", file.specific.gene = "list_specific_gene.txt",
file.name.unique.profile = "specific_unique_profile.txt")



参数----------Arguments----------

参数：L.specific.result
The L.specific.result list of the included in the result of the main SpeCond function: generalResult$specificResult$L.specific.result
L.specific.result名单在主要SpeCond函数的结果包括：generalResult $ specificResult美元L.specific.result


参数：file.name.profile
The name of the produced file containing the gene's profiles
生产含有基因的配置文件的文件名


参数：file.specific.gene
The name of the produced file containing the list of the specific genes
所生产的含有特定基因的列表文件的名称


参数：file.name.unique.profile
The name of the produced file containing the unique gene's profiles
生产含有独特的基因的配置文件的文件名


作者（S）----------Author(s)----------


Florence Cavalli, florence@ebi.ac.uk




参见----------See Also----------

SpeCond, getProfile, writeUniqueProfileSpecifcResult,
SpeCond，getProfile，writeUniqueProfileSpecifcResult


举例----------Examples----------


library(SpeCond)
data(expressionSpeCondExample)
##Perform the condition specific detection analysis with SpeCond()[＃执行的具体检测分析与SpeCond条件（）]
generalResult=SpeCond(expressionSpeCondExample, param.detection=NULL,
multitest.correction.method="BY", prefix.file="E", print.hist.pv=TRUE, fit1=NULL,
fit2=NULL, specificOutlierStep1=NULL)
specificResult=generalResult$specificResult

##write the SpeCond results files[＃写的SpeCond结果文件。]
writeSpeCondResult(specificResult$L.specific.result,file.name.profile=
"Example_specific_profile.txt", file.specific.gene="Example_list_specific_gene.txt",
  file.name.unique.profile="Example_specific_unique_profile.txt")

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