R语言 snpStats包 read.mach()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

read.mach(snpStats)
read.mach()所属R语言包：snpStats

                                         Read genotypes imputed by the MACH program
                                         阅读马赫程序归咎于基因型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This routine reads imputed genotypes generated by the MACH program. With the --mle and --mldetails options in force this program generates a .mlprob output file which contains probabilities of assignments. These are stored as uncertain genotype calls in a SnpMatrix object
此例程读取由马赫程序生成的估算基因型。与--mle和--mldetails在部队这个程序选项生成一个.mlprob输出文件，其中包含任务的概率。这些不确定基因型SnpMatrix对象调用存储


用法----------Usage----------


read.mach(file, colnames = NULL, nrow = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：file
The name of the .mlprob file. This may be gzipped  
的.mlprob文件的名称。这可能是gzip压缩


参数：colnames
The column names. If absent, names are generated as SNP1, SNP2, etc.  
列名。如果缺席，名称生成SNP1，SNP2等


参数：nrow
If known the number of rows of data on the file. If not supplied, it is determined by a preliminary pass through the data  
如果已知文件上的数据行数。如果没有提供，它是由通过数据的初步通


Details

详情----------Details----------

No routine is explicitly available for data on chromosome X. Such data should first be read as a SnpMatrix and then coerced to an XSnpMatrix object
没有例行这些数据X染色体上的数据是明确的，首先应读为SnpMatrix然后强迫XSnpMatrix对象


值----------Value----------

An object of class SnpMatrix
一个对象的类SnpMatrix


作者（S）----------Author(s)----------


David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

SnpMatrix-class
SnpMatrix-class


举例----------Examples----------


##---- No example available yet[＃----还没有例子可]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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