R语言 snpStats包 ImputationRules-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ImputationRules-class(snpStats)
ImputationRules-class()所属R语言包：snpStats

                                        Class "ImputationRules"
                                         类“ImputationRules”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A class defining a list "rules" for imputation of SNPs. Rules are  estimated population
A类定义的SNPs归集列表“规则”。规则是人口估计


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects are lists of rules. Rules are named list elements each describing imputation of a SNP by a linear regression equation. Each element is itself a list with the following elements:
对象是规则的列表。命名规则列表中的元素通过线性回归方程描述归集每一个SNP。每个元素本身是一个包含下列元素的列表：




maf The minor allele frequency of the imputed SNP
农林部估算SNP等位基因频率




r.squared The squared Pearson correlation coefficient between
r.squared皮尔森之间的相关系数的平方




snps The names of the SNPs to be included in the regression.
单核苷酸多态性的单核苷酸多态性的名字被列入回归。




hap.probs A numerical array containing estimated probabilities for haplotypes of the SNP to be imputed and all the
hap.probs一个数值数组，其中包含的SNP单体型估计的概率是估算和所有

If any target SNP is monomorphic, the corresponding rule is returned as NULL. An object of class ImputationRules has an attribute, Max.predictors, which gives the maximum number of predictors used for any imputation.
如果任何目标SNP是单态的，则返回相应的规则NULL。 ImputationRules类的对象有一个属性，Max.predictors，从而使任何归集使用的最大预测数。


方法----------Methods----------




show signature(object = "ImputationRules"): prints
显示signature(object = "ImputationRules")：打印




summary signature(object = "ImputationRules"): returns a table which shows the distribution of r-squared values
摘要signature(object = "ImputationRules")：返回一个表，其中显示了R-平方值的分布




plot signature(x="ImputationRules", y="missing"):
图signature(x="ImputationRules", y="missing")：




[] signature(x = "ImputationRules", i = "ANY"): subset
[]signature(x = "ImputationRules", i = "ANY")：子集


作者（S）----------Author(s)----------


David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

snp.imputation, impute.snps, single.snp.tests
snp.imputation，impute.snps，single.snp.tests


举例----------Examples----------


showClass("ImputationRules")

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注：
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