R语言 snpStats包 Fst()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

Fst(snpStats)
Fst()所属R语言包：snpStats

                                         Calculate fixation indices
                                         计算固定指数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculates the fixation index Fst for each SNP, together with its weight in the overall estimate (as used by the Internation HapMap Consortium).
此函数计算每个SNP的固定指数FST，连同其整体估计的重量（如由国际HapMap协作组）。


用法----------Usage----------


Fst(snps, group)



参数----------Arguments----------

参数：snps
an object of class SnpMatrix or XSnpMatrix containing the  SNP data
一个对象类SnpMatrix或XSnpMatrix包含的SNP数据


参数：group
a factor (or object than can be coerced into a factor), of length equal to the number of rows of snps, giving the grouping or rows for which the Fst is to be calculated
因素（或对象可以比被迫进入一个因素），长度等于行数snps，使分组或行要计算其中的Fst


值----------Value----------

A list:
一个列表：




Fst Fst values for each SNP
每个SNP的FST FST值




weight The weights for combining these into a single index
结合到一个单一的指数，体重的重量


注意----------Note----------

Uncertain genotypes are treated as missing
不确定基因型被视为失踪


作者（S）----------Author(s)----------


David Clayton <a href="mailto:david.clayton@cimr.cam.ac.uk">david.clayton@cimr.cam.ac.uk</a>




举例----------Examples----------



## Analysis of some HapMap data[＃一些HapMap数据的分析]

data(for.exercise)
f <- Fst(snps.10, subject.support$stratum)
weighted.mean(f$Fst, f$weight)


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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