R语言 SNPchip包 plotSnp()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotSnp(SNPchip)
plotSnp()所属R语言包：SNPchip

                                        Plots copy number and genotype calls against physical position
                                         图对物理位置复制数量和基因型分型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns an object inheriting from class ParESet – essentially, a list of default graphical parameters that can be modified as needed. The show method for this class plots the copy number and genotype calls versus physical position for an arbitrary number of samples and chromosomes.
返回类对象继承ParESet - 本质上，可以根据需要修改默认的图形参数列表。 show方法，这个类图与物理位置任意数量的样品和染色体的拷贝数和基因型分型。


用法----------Usage----------


plotSnp(object, hmmPredict, ...)
## S4 method for signature 'SnpLevelSet'
plot(x, y, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object, x
An object extending ParESet
延长ParESet对象


参数：hmmPredict, y
An object of class HmmPredict
一个对象的类HmmPredict


参数：...
Additional arguments to the initialization methods of the ParESet classes
额外的参数ParESet类的初始化方法


Details

详情----------Details----------

See examples in the vignette
小品文中的例子


作者（S）----------Author(s)----------


R. Scharpf



参见----------See Also----------

par, ParESet-class, ParSnpCallSet-class, ParSnpCopyNumberSet-class, ParSnpSet-class
par，ParESet-class，ParSnpCallSet-class，ParSnpCopyNumberSet-class，ParSnpSet-class


举例----------Examples----------


data(sample.snpset)
graph.par <- plot(sample.snpset[chromosome(sample.snpset) < 5, ])

class(graph.par)
## Not run: [＃无法运行：]
        ## to plot the data, the following are equivalent[＃绘制的数据，下面是等价的]
        graph.par
        # or[或]
        show(graph.par)
        # or[或]
        print(graph.par)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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