plotCytoband(SNPchip)
plotCytoband()所属R语言包:SNPchip
Plots idiogram for one chromosome
图idiogram一个染色体
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Adds cytobands to views of chromosome copy number and
染色体拷贝数的意见,并添加cytobands
用法----------Usage----------
plotCytoband(chromosome, cytoband, cytoband.ycoords, xlim, ylim=c(0, 2),
new=TRUE, label.cytoband=TRUE, label.y=NULL, srt, cex.axis=1,
outer=FALSE, taper=0.15, verbose=FALSE, build="hg18", ...)
参数----------Arguments----------
参数:chromosome
character string or integer: which chromosome to draw the cytoband
字符串或整数:哪个染色体提请cytoband的
参数:cytoband
data.frame containing cytoband information
数据框包含cytoband信息
参数:cytoband.ycoords
numeric: y coordinates
数字:y坐标
参数:xlim
x-axis limits
X-轴的限制
参数:ylim
y-axis limits
Y轴限制
参数:new
logical: new plotting device
逻辑:新的打印设备
参数:label.cytoband
logical: if TRUE, labels the cytobands
逻辑:如果为TRUE,标签cytobands
参数:label.y
numeric: height (y-coordinate) for cytoband label
数字:高度cytoband标签(y坐标)
参数:srt
string rotation for cytoband labels. See par
字符串旋转cytoband标签。看到par
参数:cex.axis
size of cytoband labels. See par
大小的cytoband标签。见第
参数:outer
logical: whether to draw the labels in the outer margins. See par
逻辑:是否绘制在外层边缘的标签。见第
参数:taper
tapering for the ends of the cytoband
尖细的两端cytoband
参数:verbose
Logical. If TRUE, displays human genome build used to annotated the cytoband coordinates.
逻辑。如果是TRUE,显示人类基因组的建立,用来注明cytoband坐标。
参数:build
Character string. Currently only "hg18" is allowed.
字符串。目前只有“hg18”是允许的。
参数:...
additional arguments to plot
额外的参数,绘制
作者(S)----------Author(s)----------
Robert Scharpf and Jason Ting
参见----------See Also----------
plotSnp, cytoband
plotSnp,cytoband
举例----------Examples----------
plotCytoband("1")
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|