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R语言 SLqPCR包 normPCR()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:30:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
normPCR(SLqPCR)
normPCR()所属R语言包:SLqPCR

                                         Normalization of real-time quantitative RT-PCR data
                                         实时定量RT-PCR数据的标准化

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function can be used to normalize real-time quantitative RT-PCR data.
此功能可用于实时定量RT-PCR数据标准化。


用法----------Usage----------


normPCR(relData, HKs, method = "Vandesompele", na.rm = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:relData
matrix or data.frame containing relative quantities (genes in columns)  
矩阵或数据框包含相对数量(列的基因)


参数:HKs
integer, column numbers of housekeeping genes  
整数,列数看家基因


参数:method
method for the computation  
计算方法


参数:na.rm
a logical value indicating whether NA values should be stripped before the computation proceeds.  
一个逻辑值,指示是否NA值前应计算收益剥离。


Details

详情----------Details----------

This function can be used to normalize real-time quantitative RT-PCR data.  The default method "Vandesompele" was proposed by  Vandesompele et al. (2002).
此功能可用于实时定量RT-PCR数据标准化。默认的方法"Vandesompele"提出由Vandesompele等。 (2002年)。

Currently, only the method by Vandesompele et al. (2002) is implemented.
目前,只有由Vandesompele等方法。 (2002年)实施。


值----------Value----------

Normalized expression data
规范化表达数据


作者(S)----------Author(s)----------


Dr. Matthias Kohl (SIRS-Lab GmbH) <a href="mailto:kohl@sirs-lab.com">kohl@sirs-lab.com</a>



参考文献----------References----------

normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging  of multiple internal control genes.  Genome Biology 2002. 3(7):research0034.1-0034.11. http://genomebiology.com/2002/3/7/research/0034/

举例----------Examples----------


data(SLqPCRdata)
relData <- apply(SLqPCRdata, 2, relQuantPCR)
geneStabM(relData[,c(3,4)])
exprData <- normPCR(SLqPCRdata, c(3,4))

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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