twoWayTable(SLGI)
twoWayTable()所属R语言包:SLGI
Generate two-way table for genetic interaction data
产生的遗传相互作用数据的双向表
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Generate two-way table from a vector of genetic interaction status and a vector of the pairs that share a functional domain.
从遗传相互作用的状态向量和向量共享一个功能域对产生双向表。
用法----------Usage----------
twoWayTable(var1, var2idx)
参数----------Arguments----------
参数:var1
Vector of the status of the first property.
向量的第一个属性的状态。
参数:var2idx
Vector of the index in var1 that have the second property.
向量var1有第二个属性的索引。
Details
详情----------Details----------
Calculates the count numbers from the given vectors. Then put them into a matrix format.
计算从给定的向量计数号码。然后放入一个矩阵格式。
值----------Value----------
A two-way contingency table of genetic interaction and whether sharing
遗传相互作用,以及是否共享一个双向的应变表
作者(S)----------Author(s)----------
Z. Jiang
参见----------See Also----------
sharedBy, getUniquePairs
sharedBy,getUniquePairs
举例----------Examples----------
var1 <- c(0,1,1,0,0,0,1,0,1,1)
var2idx <- c(3,5,7)
twoWayTable(var1,var2idx)
data("AtongFnDomain")
pf <- Biobase::reverseSplit(AtongFnDomain$SharedPfam)
idx <- which(rownames(AtongFnDomain$pairs) %in% pf$PF00478)
twoWayTable(AtongFnDomain$pairs[,"interact"],idx)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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