sharedInt(SLGI)
sharedInt()所属R语言包：SLGI
List shared genetic interactions between genes
列表共享基因之间的遗传相互作用
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
List shared interactions and cellular organizational units names between genes.
列表共享的相互作用和单元组织单位的名称，基因之间。
用法----------Usage----------
sharedInt(pairL, interactome, threshold=0)
参数----------Arguments----------
参数：pairL
Dataframe with 3 columns. The first columns are the pair of genes tested i.e., the query and array genes. The third columns in a logical: TRUE when the 2 genes genetically interact and FALSE when they do not.(see AtongPair dataset as example)
3列Dataframe用。第一列是对基因测试，查询和阵列基因。在逻辑的第三列：TRUE时2个基因的基因相互作用和FALSE，当他们不这样做（见AtongPair集为例）。
参数：interactome
Adjacency matrix where row are gene names and columns are cellular organizational units names. Each entry has value 0 or 1, for absence or presence of a gene in the complex.
其中行是基因名称和列的邻接矩阵是单元的组织单位名称。每个条目都有值0或1，缺席或在复杂的基因的存在。
参数：threshold
Numeric. Indicate the minimum number of interactions that 2 genes must share
数字。表明相互作用的最低数量2基因必须共享
值----------Value----------
The return value is a list. Each element of the list has for name 2 genes that genetically interact. Each element of the list corresponds to the list of cellular organizational units where the interacting genes are found (independently or together).
返回值是一个列表。列表中的每个元素的名称2基因相互作用的基因。列表中的每个元素对应的单元相互作用的基因被发现（独立或联合）组织单位名单。
作者（S）----------Author(s)----------
N. LeMeur
举例----------Examples----------
## Synthetic genetic interactions [＃合成的遗传相互作用]
dat <- data.frame("query" = LETTERS[1:5], "array" = LETTERS[2:6], "interact" = as.logical(sample(c(TRUE, FALSE), 5, TRUE)))
## interactome[＃相互作用组]
interA <- matrix(sample(c(0, 1), 30,TRUE), nrow=6, ncol=5,dimnames = list(LETTERS[1:6], letters[1:5]))
sharedInt(dat, interA, threshold=1)
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 14:29:35
