sharedBy(SLGI)
sharedBy()所属R语言包:SLGI
Find the gene pairs that share a domain.
发现基因对共享域。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
sharedBy finds whether the given domain is in each of the elements of the domain list.
sharedBy发现是否给定域的域列表的每个元素。
用法----------Usage----------
sharedBy(domainL)
参数----------Arguments----------
参数:domainL
is a list, each element of the list is a vector of domains.
是一个列表,列表中的每个元素是一个域的向量。
Details
详情----------Details----------
sharedBy first remove all the elements with length 0 or have value 'NA'. Then apply the reverseSplit on the remaining list.
sharedBy先删除所有长度为0的元素,或有“不适用”的价值。然后套用其余名单上的reverseSplit。
值----------Value----------
A list with each element represent a domain, and the values of the element are the pairs that share this domain.
每个元素的列表域,元素的值是对分享这个域名。
作者(S)----------Author(s)----------
Z. Jiang
参见----------See Also----------
reverseSplit, domainDist,
reverseSplit,domainDist
举例----------Examples----------
## Load PFAM and SMART domains shared between Tong's Synthetic lethal data[#加载PFAM和SMART域塘的合成致死数据共享]
data(AtongFnDomain)
## Find pair that share identical domain[#找到一双共享相同的域。]
sharedBy(AtongFnDomain$SharedPfam[1:20])
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