R语言 SLGI包 normInteraction()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normInteraction(SLGI)
normInteraction()所属R语言包：SLGI

                                        Normalize a matrix of biological interactions
                                         规范化的生物相互作用的矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Normalize a square matrix of biological interactions according to the number of possible interactions between each biological complex.
标准化根据每个生物的复杂之间的相互作用的生物相互作用的方阵。


用法----------Usage----------


normInteraction(data, genename, interactome)



参数----------Arguments----------

参数：data
Square Matrix of biological complexes that shares one or more genes(proteins)
生物复合物的方阵，股份的一个或多个基因（蛋白质）


参数：genename
Character vector of the gene names that possibly create interactions between complexes
可能创建复合物之间的相互作用的基因名称的特征向量


参数：interactome
Adjacency matrix where row are genes and columns are cellular organizational units. Each entry has value 0 or 1, for absence or presence of a gene in a complex, e.g., ScISI
其中行是基因和列的邻接矩阵是单元组织单位。每个条目都有值0或1，在一个复杂的基因缺失或存在，例如，ScISI


值----------Value----------

Square matrix of biological complexes linked by one or more interacting proteins and normalized by the possible number of interactions between each complex.
方阵挂钩由一个或多个蛋白质相互作用和彼此之间复杂的相互作用可能标准化的生物复合物。


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



参见----------See Also----------

getInteraction
getInteraction


举例----------Examples----------


data(Atong)
data(ScISIC)
data(SGA)
SLa2 <- gi2Interactome(Atong, ScISIC)
## Search for synthetic lethal interaction[＃搜索合成致命的相互作用]
compM <- getInteraction(SLa2, SGA, ScISIC)
## Normalize[＃标准化]
normIntComplex<- normInteraction(compM$bwMat, SGA, ScISIC)

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