hyperG(SLGI)
hyperG()所属R语言包:SLGI
Hypergeometric test
超几何测试
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
a hypergeometric test for genetic interaction data.
一个遗传相互作用数据的超几何试验。
用法----------Usage----------
hyperG(data, nbTested, universe)
参数----------Arguments----------
参数:data
Matrix with 2 columns the first one corresponds to the number of interactions per pair of interacting complexes and the second one to number of tested interactions. This could be the first two columns resulting from a call to the test2Interact function.
矩阵2列的第一个对应的每对相互作用的复合物和一些行之有效的相互作用的第二个互动。这可能是前两列test2Interact函数的调用。
参数:nbTested
Number of interacting pairs
相互作用对数
参数:universe
Total Number of tested pairs
测试对总数
作者(S)----------Author(s)----------
N. LeMeur
参见----------See Also----------
phyper
phyper
举例----------Examples----------
## Create matrix interaction x tested matrix[#创建矩阵互动x测试矩阵]
interact <- c(1, 3, 2, 2, 6, 5, 2, 4, 1, 3)
tested <- c(3, 3, 5, 4, 8, 5, 3, 4, 2, 3)
mat <- cbind(interact, tested)
## Perform test[#执行测试]
res <- hyperG(mat, 1000, 10000)
summary(res$P)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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