R语言 SLGI包 gi2Interactome()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

gi2Interactome(SLGI)
gi2Interactome()所属R语言包：SLGI

                                        Reduce genetic interactions matrix
                                         减少遗传相互作用矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reduce genetic interactions matrix to the pairs that genetically interact and that are present in the interactome of interest.
减少矩阵对基因相互作用，是在利益的相互作用组目前的遗传相互作用。


用法----------Usage----------


gi2Interactome(iMat, interactome, threshold=0)



参数----------Arguments----------

参数：iMat
Genetic interaction matrix. Each entry has usually  a value of 0 or 1, representing positive or negative interaction of corresponding pairs of row and column, respectively.  
遗传相互作用矩阵。通常每个条目都有一个值为0或1，分别代表相应的对行和列的积极或消极的相互作用，。


参数：interactome
Interactome matrix, e.g. ScISIC.  
相互作用组矩阵，例如： ScISIC。


参数：threshold
Integer
整数


值----------Value----------

The returned value is the  genetic interaction matrix  reduced to the row and column (genes) names that are present in the interactome and where the row and column sums are higher than the specified threshold.
返回值是减少遗传相互作用矩阵的行和列（基因）在相互作用组的名称和所在的行和列的款项高于指定的阈值。


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



举例----------Examples----------


##Create the genetic interaction matrix[＃创建的遗传相互作用矩阵]
gInt <- sample(c(0, 1), 25, TRUE)
iMat  <- matrix(gInt, nrow=5, ncol=5, dimnames=list(letters[1:5],letters[4:8]))

##Create the interactome[＃创建的相互作用组]
cInt <- sample(c(0,1),30, TRUE)
interactome  <- matrix(cInt, nrow=6, ncol=5,dimnames=list(letters[2:7],LETTERS[1:5]))

## Reduce the genetic interaction matrix to match the gene present in[＃减少匹配的基因存在于遗传相互作用矩阵]
## the interactome[＃在相互作用组]
reducediMat <- gi2Interactome(iMat, interactome)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。