getTestedPairs(SLGI)
getTestedPairs()所属R语言包：SLGI
Find interacting and non-interacting tested pairs from an genetic interaction matrix.
发现从遗传相互作用矩阵的相互作用和非相互作用对测试。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
getTestedPairs find all the pairs from an interaction matrix and a list of tested genes.
getTestedPairs找对从基因测试的互动矩阵和列表。
用法----------Usage----------
getTestedPairs(iMat, respV)
参数----------Arguments----------
参数：iMat
Adjacency matrix reporting genetic Interactions. Each entry has value 0 or 1, representing positive or negative interaction of corresponding pairs of row and column, respectively.
邻接矩阵报告遗传相互作用。每个条目都有值0或1，表示积极或消极的相互作用相应的对行和列分别。
参数：respV
Character vector of all gene names that were tested (found to interact or not)
特征向量的所有基因进行名称（发现交互或不）
值----------Value----------
A data.frame with 4 columns:
一个4列数据框：
参数：query
gene names of the query genes
查询基因的基因名称
参数：array
gene names og the tested genes (e.g., array genes)
基因名称OG测试基因（例如，阵列基因）
参数：interact
numeric vector of the number of observed interactions (0: no interaction; 1: one interaction; 2: two interactions when the query genes were also on the array)
数字向量的号码（0：没有互动; 1：一个互动; 2：两个互动的查询基因阵列也观测到的相互作用）
参数：recip
logical to indicate whether the reported genes were both query and array genes (TRUE: both genes were query and array genes) </table>
逻辑表明，报告基因是否是查询和阵列基因（TRUE，这两个基因分别查询和阵列基因）</ TABLE>
.
。
作者（S）----------Author(s)----------
N. LeMeur
参见----------See Also----------
getSharedDomains getUniquePairs
getSharedDomainsgetUniquePairs
举例----------Examples----------
intM <- c(0,1,0,0,1,1,0,0,1,0,0,1,1,0,1,0)
dim(intM) <- c(4,4)
dimnames(intM) <- list(c("p1","p2","p3","p4"),c("p1","p3","p5","p7") )
respV <- c("p6","p8")
intM
getTestedPairs(intM,respV)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 14:27:54
