getFASTAname(SLGI)
getFASTAname()所属R语言包:SLGI
Obtain sequence name from FASTA object
FASTA格式的对象,获得序列的名称
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Extract the name of a sequence from a FASTA object that created by readFASTA function from Biostrings package.
提取readFASTABiostrings包的功能创建一个FASTA对象序列名。
用法----------Usage----------
getFASTAname(Fobj)
参数----------Arguments----------
参数:Fobj
is a FASTA object created by readFASTA function from Biostrings
是一个FASTA对象创建readFASTA从Biostrings功能,
Details
详情----------Details----------
The function gets the first string between ">" and space the "desc" element of the Fobj, which is the names of the sequence.
该函数获得的的Fobj,这是序列的名字“DESC”元素“>”和空间之间的第一个字符串。
值----------Value----------
A character string.
一个字符串。
作者(S)----------Author(s)----------
Z. Jiang
参见----------See Also----------
readFASTA
readFASTA
举例----------Examples----------
f <- gzfile(file.path(.path.package("SLGI"),
"extdata/orf_trans.fasta.gz"), open = "rt")
library(Biostrings)
yeastF <- readFASTA(f)
sapply(yeastF[1:5], getFASTAname)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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