R语言 SLGI包 compare()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

compare(SLGI)
compare()所属R语言包：SLGI

                                        Compare observed data to expected in permutation models
                                         在置换模型的预期比较观测数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This method summarizes the result of the modelSLGI function.
这种方法总结的modelSLGI函数的结果。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'siResult'
compare(x)



参数----------Arguments----------

参数：x
a siResult object to summarize
siResult对象总结


Details

详情----------Details----------

This compares the number of observed interactions to the number of expected interactions in each permutation model. It counts how many times the number of observed interactions is greater than the number of expected interactions (from the permutations) and divides by the number
与此相比，观察相互作用的数量在每个置换模型预期的相互作用。它计算多少次观测相互作用的数量是大于预期的相互作用（排列）的数量和数量分为


值----------Value----------

Numerical vector
数值向量


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



参见----------See Also----------

modelSLGI
modelSLGI


举例----------Examples----------


data(ScISIC)
data(Atong)
data(SGA)
model <-  modelSLGI(Atong, universe= SGA, interactome=ScISIC, type="intM", perm=2)
ans <- compare(model)

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