R语言 simpleaffy包 qc()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

qc(simpleaffy)
qc()所属R语言包：simpleaffy

                                         Generate QC stats from an AffyBatch object
                                         从AffyBatch对象产生的QC统计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generate QC metrix for Affymetrix data.
生成的QC Metrix的Affymetrix数据。


用法----------Usage----------


qc(unnormalised, ...)



参数----------Arguments----------

参数：unnormalised
An AffyBatch object with nowt done to it  
一个与nowt AffyBatch对象做


参数：...
Any other parameters  
任何其他参数


Details

详情----------Details----------

Affymetrix recommend a series of QC metrics that should be used to check that arrays have hybridised correctly and that sample quality is acceptable. These are discussed in the document 'QC and Affymetrix data' accompanying this package, and on the web at http://bioinformatics.picr.man.ac.uk. They are described in detail in the 'Expression Analysis Fundamentals' manual available from Affymetrix.
Affymetrix公司推荐一系列的质量控制指标的，应当用于检查阵列hybridised的正确，该样品的质量是可以接受的。讨论这些文件的质量控制和Affymetrix数据的陪同这个包，并在http://bioinformatics.picr.man.ac.uk网页上。他们详细描述了在“表达分析基础”手册，可从Affymetrix公司。

Before using this function you are strongly encouraged to read the 'QC and Affymetrix data' document, which contains detailed examples.
使用此功能前，您正在大力鼓励阅读的“QC和Affymetrix数据的文件，其中包含详细的例子。

This function takes an AffyBatch object and generates a QCStats  object containing a set of QC metrics. See qc.affy for more details.
这个函数需要一个AffyBatch对象，并生成一个QCStats对象，它包含了一套质量控制指标。看到qc.affy更多细节。


作者（S）----------Author(s)----------


Crispin J Miller



参见----------See Also----------

qc.affy setQCEnvironment
qc.affysetQCEnvironment


举例----------Examples----------


  ## Not run: [＃无法运行：]
    qcs <- qc(eset,eset.mas)
  
## End(Not run)[＃结束（不运行）]
  data(qcs)
  ratios(qcs)
  avbg(qcs)
  maxbg(qcs)
  minbg(qcs)
  spikeInProbes(qcs)
  qcProbes(qcs)
  percent.present(qcs)
  plot(qcs)
  sfs(qcs)
  target(qcs)
  ratios(qcs)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。