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R语言 simpleaffy包 justMAS()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:20:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
justMAS(simpleaffy)
justMAS()所属R语言包:simpleaffy

                                         Generate Expression calls using a C implementation of the MAS 5.0 Algorithm
                                         使用MAS的C实现5.0算法生成表达式调用

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Implements the MAS5.0 background correction, expression summary and scaling functions as described in Affy's 'Statistical Algorithms Description Document'
实现MAS5.0背景校正,表达总结和缩放功能Affy的统计算法描述文件“中所述


用法----------Usage----------


  justMAS(unnormalised,tgt=100,scale=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:unnormalised
An unnormalised AffyBatch object  
一个unnormalised AffyBatch对象


参数:tgt
The target intensity to scale array to, if scaling.
目标强度扩展阵列,如果缩放。


参数:scale
Scale the data to the specified target intensity.
数据缩放到指定的目标强度。


Details

详情----------Details----------

Uses a C code implementation of the MAS5.0 algorithm (As described in Affymetrix's 'Statistical Algorithms Reference Guide' - see  http://www.affymetrix.com, and in Hubbell et al. (2002) Robust Estimators for expression analysis. Bioinformatics 18(12) 1585-1592). Note that this function returns log2 data.
使用的Affymetrix公司的统计算法参考指南“中所述的MAS5.0算法(C代码实现 - 见http://www.affymetrix.com,哈贝尔等人(2002)稳健估计的表达分析的生物信息学。 18(12)1585年至1592年)。请注意,这个函数返回log2数据。


值----------Value----------

An AffyBatch object, with, in addition, scale-factors for each array stored in the object's description@preprocessing@sfs slot, and the target intensity the arrays were scaled to in  description@preprocessing@tgt
一个AffyBatch对象,此外,规模因素为每个阵列存储对象的description@preprocessing@sfs插槽,目标强度的阵列,缩放在description@preprocessing@tgt


作者(S)----------Author(s)----------


Crispin J Miller



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


   ## Not run: [#无法运行:]
     eset.mas <- justMAS(eset.mas);   
   
## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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