SolexaExportQA-class(ShortRead)
SolexaExportQA-class()所属R语言包:ShortRead
Quality assessment summaries from Solexa export and realign files
出口公司Solexa的质量评估总结和调整文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This class contains a list-like structure with summary descriptions derived from visiting one or more Solexa "export" or "realign" files.
这个类包含一个列表结构与访问一个或多个公司Solexa“出口”或“重新调整”的文件的摘要描述。
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects of the class are usually produced by a qa method.
类的对象通常是由一个qa方法。
插槽----------Slots----------
.srlist: Object of class "list", containing data frames or lists of data frames summarizing the results of
.srlist类"list",包含的数据框或数据框列表的对象,总结的结果
延伸----------Extends----------
Class "SRList", directly. Class ".QA", directly. Class ".SRUtil", by class "SRList", distance 2. Class ".ShortReadBase", by class ".QA", distance 2.
类"SRList",直接。类".QA",直接。类".SRUtil",由类“SRList”,距离为2。类".ShortReadBase"“类”。质量保证“,距离为2。
方法----------Methods----------
Accessor methods are inherited from the SRList class.
SRList类继承的存取方法。
Additional methods defined on this class are:
在这个类中定义的另一种方法是:
report signature(x="SolexaExportQA", ..., dest=tempfile(), type="html"): produces HTML files summarizing QA results. dest should be
报告signature(x="SolexaExportQA", ..., dest=tempfile(), type="html"):总结质量保证结果的HTML文件。 dest应该
report signature(x="SolexaExportQA", ..., dest=tempfile(), type="pdf"): (deprecated; use type="html" instead) produces a pdf file
报告signature(x="SolexaExportQA", ..., dest=tempfile(), type="pdf"):(不推荐使用type="html"代替)产生的PDF文件
report signature(x="SolexaRealignQA", ..., dest=tempfile(), type="html"): produces HTML files summarizing QA results. dest should be
报告signature(x="SolexaRealignQA", ..., dest=tempfile(), type="html"):总结质量保证结果的HTML文件。 dest应该
作者(S)----------Author(s)----------
Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>
参见----------See Also----------
qa.
qa。
举例----------Examples----------
showClass("SolexaExportQA")
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