countLines(ShortRead)
countLines()所属R语言包:ShortRead
Count lines in all (text) files in a directory whose file name
(文本)文件中的行计数的文件名目录
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
countLines visits all files in a directory path dirPath whose base (i.e., file) name matches pattern. Lines in the file are counted as the number of new line characters.
countLines访问所有文件在一个目录路径dirPath为基础(即文件)的名称相匹配pattern。文件中的行的新行字符数计算。
用法----------Usage----------
countLines(dirPath, pattern=character(0), ..., useFullName=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:dirPath
A character vector (or other object; see methods defined on this generic) giving the directory path (relative or absolute) of files whose lines are to be counted.
一个特征向量(或其他对象;看到这个通用定义的方法)给线计算文件的目录路径(相对或绝对)。
参数:pattern
The (grep-style) pattern describing files whose lines are to be counted. The default (character(0)) results in line counts for all files in the directory.
(grep式)模式描述文件,其线计算。默认(character(0))目录中的所有文件的行数的结果。
参数:...
Additional arguments, passed internally to list.files. See list.files.
额外的参数,内部传递到list.files。看到list.files。
参数:useFullName
A logical(1) indicating whether elements of the returned vector should be named with the base (file) name (default; useFullName=FALSE) or the full path name (useFullName=TRUE).
一个logical(1)返回向量的元素是否应与碱基(档案)名称命名(默认;useFullName=FALSE)的完整路径名(useFullName=TRUE)。
值----------Value----------
A named integer vector of line counts. Names are paths to the files whose lines have been counted, excluding dirPath.
命名的整数向量的行数。名线已算到的文件的路径,不包括dirPath。
作者(S)----------Author(s)----------
Martin Morgan
举例----------Examples----------
sp <- SolexaPath(system.file('extdata', package='ShortRead'))
countLines(analysisPath(sp))
countLines(experimentPath(sp), recursive=TRUE)
countLines(experimentPath(sp), recursive=TRUE, useFullName=TRUE)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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