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R语言 ShortRead包 clean()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 14:03:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
clean(ShortRead)
clean()所属R语言包:ShortRead

                                        Remove sequences with ambiguous nucleotides from short read classes
                                         从短期看类模棱两可的核苷酸序列

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Short reads may contain ambiguous base calls (i.e., IUPAC symbols different from A, T, G, C). This generic removes all sequences containing 1 or more ambiguous bases.
短读取可能包含歧义的基础呼叫(即不同的国际化联的A,T,G,C字符号)。这通用移除所有序列含有1个或多个暧昧碱基。


用法----------Usage----------


clean(object, ...)



参数----------Arguments----------

参数:object
An object for which clean methods exist; see below to discover these methods.  
对象clean方法存在;见下面发现这些方法。


参数:...
Additional arguments, perhaps used by methods.
额外的参数,也许使用的方法。


Details

详情----------Details----------

The following method is defined, in addition to methods described in class-specific documentation:
下面的方法定义,除了类特定的文件中所描述的方法:




clean signature(x = "DNAStringSet"): Remove all sequences containing non-base (A, C, G, T) IUPAC
清理signature(x = "DNAStringSet"):删除所有序列含有非碱基(一,C,G,T),国际化联


值----------Value----------

An instance of class(object), containing only sequences with non-redundant nucleotides.
一个class(object)的实例,只与非冗余的核苷酸序列。


作者(S)----------Author(s)----------


Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>



举例----------Examples----------


showMethods('clean')

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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