BAMQA-class(ShortRead)
BAMQA-class()所属R语言包:ShortRead
Quality assessment from BAM files
BAM的文件的质量评估
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This class contains a list-like structure with summary descriptions derived from visiting one or more BAM files.
这个类包含了访问一个或更多的BAM文件的简要说明列表状结构。
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects of the class are usually produced by a qa method, with the argument type="BAM".
类对象通常是由一个qa方法,参数type="BAM"。
插槽----------Slots----------
.srlist: Object of class "list", containing data frames or lists of data frames summarizing the results of
.srlist类"list",包含的数据框或数据框列表的对象,总结的结果
延伸----------Extends----------
Class "SRList", directly. Class ".QA", directly. Class ".SRUtil", by class "SRList", distance 2. Class ".ShortReadBase", by class ".QA", distance 2.
类"SRList",直接。类".QA",直接。类".SRUtil",由类“SRList”,距离为2。类".ShortReadBase"“类”。质量保证“,距离为2。
方法----------Methods----------
Accessor methods are inherited from the SRList class.
SRList类继承的存取方法。
report signature(x="BAMQA", ..., dest=tempfile(), type="html"): produces an
报告signature(x="BAMQA", ..., dest=tempfile(), type="html"):产生
作者(S)----------Author(s)----------
Martin Morgan <mtmorgan@fhcrc.org>
参见----------See Also----------
qa.
qa。
举例----------Examples----------
showClass("BAMQA")
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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