makePWM(seqLogo)
makePWM()所属R语言包:seqLogo
Constructing a pwm object
构建PWM对象的
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function constructs an object of class pwm from a matrix. It checks that the matrix has correct dimensions and that columns add up to 1.0.
这个函数构造一个矩阵类PWM的对象。它会检查该矩阵具有正确的尺寸和列加起来为1.0。
用法----------Usage----------
makePWM(pwm, alphabet="DNA")
参数----------Arguments----------
参数:pwm
matrix representing the positon weight matrix
matrix代表当前位置权重矩阵
参数:alphabet
character the alphabet making up the sequence. Currently, only "DNA" is supported.
character字母序列。目前,唯一的“DNA”的支持。
值----------Value----------
An object of class pwm.
PWM类的对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Oliver Bembom, <a href="mailto:bembom@berkeley.edu">bembom@berkeley.edu</a>
举例----------Examples----------
mFile <- system.file("Exfiles/pwm1", package="seqLogo")
m <- read.table(mFile)
pwm <- makePWM(m)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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