random.intervals(seqbias)
random.intervals()所属R语言包:seqbias
Generating random genomic intervals
生成随机的基因组间隔
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a vector of sequence lengths, generate genomic intervals uniformly at
由于序列长度的向量,生成的基因组间隔均匀
用法----------Usage----------
random.intervals(I, n=1, ms=10000)
参数----------Arguments----------
参数:I
a GRanges object giving intervals from which to sample from
1农庄品尝从对象给予间隔
参数:n
number of intervals to generate
间隔数生成
参数:ms
length of the intervals to generate (may be a vector)
长度的时间间隔生成(可能是一个向量)
Details
详情----------Details----------
The function is used to place intervals of fixed sizes at random (possibly overlapping) positions across one or more sequences. The input should be a GRanges objects giving the sequence intervals in which the random intervals sholud be placed. If they are to be placed anywhere within a reference sequence, use the scanFaIndex function from Rsamtools, to obtain a set of intervals.
的功能是用来固定大小的时间间隔放置在一个或多个序列的随机(可能重叠)的立场。输入应该是一个GRanges对象给予序列在随机的时间间隔sholud放置的时间间隔。如果它们被放置在一个参考序列中的任何位置,从Rsamtools使用scanFaIndex函数,获得一组的间隔。
值----------Value----------
Returns a GRanges object giving the generated intervals.
返回一个农庄对象,使生成的时间间隔。
作者(S)----------Author(s)----------
Daniel Jones
<a href="mailto:dcjones@cs.washington.edu">dcjones@cs.washington.edu</a>
举例----------Examples----------
library(Rsamtools)
ref_fn <- system.file( "extra/example.fa", package = "seqbias" )
ref_f <- FaFile( ref_fn )
open.FaFile( ref_f )
ref_seqs <- scanFaIndex( ref_f )
I <- random.intervals( ref_seqs, n = 100, ms = 1000 )
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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