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R语言 ScISI包 ScISI2html()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 13:58:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
ScISI2html(ScISI)
ScISI2html()所属R语言包:ScISI

                                        A function that generates an html page for the GO and MIPs
                                         函数生成的GO和MIPS的一个HTML页面

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a vector or url's and a vector of the protein complex description names (known names of the protein complexes) and creates an html file that lets the user link to each of the protein complex description site based on the particular url.
这个函数需要一个向量或URL和向量的蛋白复合物的描述名称(已知的蛋白质复合物的名称),并创建一个HTML文件,让用户根据特定URL的蛋白复合物的描述网站的链接。


用法----------Usage----------


ScISI2html(urlVect, linkName, filename, title,
othernames, table.head, table.center = TRUE, compSize=NULL)



参数----------Arguments----------

参数:urlVect
A character vector containing the url for each speficied protein complex
字符向量每个speficied蛋白复合物的URL


参数:linkName
A character vector containing a description name for each of the url's in urlVect that will be the anchor for the url
包含的URL描述为每个URL urlVect,这将是锚名称的字符向量


参数:filename
The output file; an html file written to the home directory
输出文件,HTML文件写入到主目录


参数:title
The title given to the html file
给HTML文件的标题


参数:othernames
Other titles that are needed; sub-titles
其他需要的标题,子标题


参数:table.head
The title for the table
表的标题


参数:table.center
Logical; to center the table
逻辑;中心表


参数:compSize
A numeric vector of the complex sizes for the various protein complexes of GO and MIPS
一个复杂GO和MIPS的各种蛋白质复合物的大小数值向量


值----------Value----------

An html file written to the user's home directory. The file contains a page of links (given by the url's) where each link is anchored by a description name for each url.
一个HTML文件写入到用户的家目录。该文件包含一个网页链接(网址),其中每一个环节是由锚定为每个URL的描述名称。


作者(S)----------Author(s)----------


Tony Chiang



举例----------Examples----------


#go = getGOInfo(wantAllComplexes = FALSE)[去= getGOInfo(wantAllComplexes = FALSE时)]
#goM = createGOMatrix(go)[GOM = createGOMatrix(去)]
#goDF = createGODataFrame(go, goM)[goDF = createGODataFrame(去,GOM)]
#goOb = createYeastDataObj(goDF)[goOb = createYeastDataObj(goDF)]
#goNames = colnames(goM)[goNames = colnames(GOM)]
#url = vector(length = length(goNames))[URL =矢量(长度=长度(goNames))]
#for(i in 1:length(goNames)){[(1 I:长度(goNames)){]
#   url[i] = getURL(goOb, goNames[i])[URL [I] =的getURL(goOb,goNames [I])]
#}[}]
#ScISI2html(url, goNames, test, GO Complexes)[ScISI2html(URL,goNames,测试,配合)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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