R语言 ScISI包 checkComplex()函数中文帮助文档(中英文对照)

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checkComplex(ScISI)
checkComplex()所属R语言包：ScISI

                                        Function to check a list of protein complexes wrt ScISI
                                         函数来检查蛋白质复合物WRT ScISI列表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a named list of protein complexes (where each protein complex name indexes an item of the list and each list entry is the protein composition of the complex) and an interactome (in the bi-partite matrix representation) and checks to see if each complex of the list is either in the interactome, a sub-complex of some complex(es) of the interactome, or a super-complex of some complex(es) of the interactome.
此功能的蛋白复合物（）和每一个蛋白复合物名称索引列表项，每个列表项的蛋白质组成的复杂的相互作用组（双向三方矩阵表示）命名名单，并检查看到，如果每个列表中的复杂，无论是在相互作用组，一分复杂的一些复杂的相互作用组（ES），或一个超级复杂的一些复杂的相互作用组（ES）。


用法----------Usage----------


checkComplex(comps, interactome)



参数----------Arguments----------

参数：comps
A named list of protein complexes. The names corresponds the protein complexes and the entries correspond to the complex composition
命名的蛋白质复合物的列表。名称对应的蛋白复合物和条目对应的成分复杂


参数：interactome
A bi-partite graph representation of some interactome
三方的一些相互作用组双向图表示


Details

详情----------Details----------

This is another QC function to check the participation of certain protein complexes. The out-put will describe how the various protein complexes in question relate to the protein complexes of the interactome in question.
这是另一个QC函数来检查某些蛋白质复合物的参与。中，输出将介绍如何在各种蛋白质复合物的问题涉及的问题相互作用组蛋白复合物。


值----------Value----------

A named list:
命名名单：


参数：equal
A named character vector - the name equals the entry
命名的特征向量 - 这个名字等于条目


参数：subset
A named char vector - the name is a subset of the entry
一个名为炭向量 - 名字是一个子项


参数：superset
A named char vector - the name is a superset of the entry
一个名为炭向量 - 这个名字是一个条目超


参数：sameNameNotEqual
A named char vector - the name is equal to the name of the entry but the composition is not equal
一个名为炭向量 - 这个名字是平等的条目的名称，但不等于组成


作者（S）----------Author(s)----------


T Chiang

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